以下、フィリピン行きのフライトが運行されている主要空港と航空会社です。航空会社によっては乗り換えが必要な場合もございます。詳しい情報は各航空会社のホームページをご参照くださいませ。最近ではLCC（格安航空会社）も増えてきており、安価な費用でフィリピンに渡航することが可能になってきています。
| 出発空港 | 行先 | 航空会社 |
|---|---|---|
| 成田空港（東京） | マニラ | フィリピン航空 セブパシフィック 日本航空（JAL） 大韓航空 |
| セブ島 | フィリピン航空 セブパシフィック 日本航空（JAL） 大韓航空 | |
| 羽田空港（東京） | マニラ | フィリピン航空 全日本空輸（ANA） 大韓航空 |
| セブ島 | フィリピン航空 全日本空輸（ANA） 大韓航空 | |
| 関西国際空港（大阪） | マニラ | ジェットスター フィリピン航空 セブパシフィック 大韓航空 |
| セブ島 | フィリピン航空 セブパシフィック 大韓航空 | |
| 中部国際空港（名古屋） | マニラ | フィリピン航空 セブパシフィック 大韓航空 |
| セブ島 | フィリピン航空 セブパシフィック 大韓航空 | |
| 福岡空港 | マニラ | フィリピン航空 大韓航空 |
| セブ島 | フィリピン航空 大韓航空 |
